L’association à été crée en mai 2006, suite à une consultation des différentes associations et composantes de la communauté musulmane. L’objet de l’association est de coordonner la levée des fonds, puis de construire le projet de la Mosquée de Marseille et d’en assurer ensuite le fonctionnement. L’association est constituée d’une assemblée représentative de la communauté musulmane de Marseille.
Une communauté diverse et plurielle
Estimée à plus de 250 000 âmes, la communauté musulmane marseillaise est diverse tant sur le plan des pays d'origine que sur le plan social, culturel ou linguistique. Si elle constitue un atout, cette diversité ne va pas sans poser quelques problèmes. Sur le plan strictement religieux, l'unité règne car la quasi-totalité sinon la totalité des marseillais de confession musulmane. Ils sont majoritairement sunnites de rite malékite. Un tiers , essentiellement des Comoriens, sont de rite chaféite. Originaires des anciennes colonies, les Musulmans marseillais ont participé aux deux conflits mondiaux dans les troupes françaises. C'est souvent ainsi qu'ils ont connu Marseille. Puis, ils sont revenus en tant qu'ouvriers, d'abord en célibataires puis rejoints par leurs familles. Ils ont participé activement aux projets de constructions dans le cadre des restructurations urbaines et ce à partir des années 60.
Mais c'est surtout suite aux indépendances, particulièrement celle de l'Algérie, que l'essentiel de cette population s'est installé durablement dans la cité phocéenne. Nombre de musulmans marseillais classés par ordre décroissant :
- Les Algériens 90 000 – 100 000
- Les Comoriens 60 000 – 70 000
- Les Tunisiens 25 000 - 30 000
- Les Africains 10 000 - 15 000
- Les Marocains 15 000 - 20 000
- Moyen-orient 10 000 - 15 000
- Convertis, autres 7 000 - 15 000
Après des années de précarité et un manque de volonté d’intégration de la première génération, on assiste, à partir des années 80, à une réelle insertion des Musulmans dans le tissu associatif, économique, culturel et politique de la ville, même si cela demeure laborieux et difficile.

